Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Zic1P46684 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zic1P46684 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms