Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klf1P46099 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klf1P46099 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms