Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf4P43488 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf4P43488 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms