Protein–RNA interactions for Protein: P41317

Mbl2, Mannose-binding protein C, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl2P41317 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mbl2P41317 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mbl2P41317 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms