Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Tnfsf9P41274 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tnfsf9P41274 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Tnfsf9P41274 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tnfsf9P41274 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf9P41274 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf9P41274 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf9P41274 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf9P41274 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf9P41274 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf9P41274 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tnfsf9P41274 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf9P41274 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tnfsf9P41274 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tnfsf9P41274 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms