Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ThpoP40226 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms