Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Csf3rP40223 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Csf3rP40223 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms