Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd1P40201 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd1P40201 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chd1P40201 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd1P40201 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd1P40201 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd1P40201 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd1P40201 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chd1P40201 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd1P40201 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd1P40201 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd1P40201 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd1P40201 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms