Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cap1P40124 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cap1P40124 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cap1P40124 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cap1P40124 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms