Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grik2P39087 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms