Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprkP35822 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprkP35822 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PtprkP35822 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprkP35822 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprkP35822 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PtprkP35822 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms