Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ddit3P35639 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ddit3P35639 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms