Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab20P35295 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab20P35295 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms