Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5cP35278 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rab5cP35278 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rab5cP35278 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rab5cP35278 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rab5cP35278 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5cP35278 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms