Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ptk2P34152 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ptk2P34152 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms