Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pola1P33609 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pola1P33609 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pola1P33609 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms