Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc5P32043 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc5P32043 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms