Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Notch4P31695 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Notch4P31695 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms