Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hoxa10P31310 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hoxa10P31310 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms