Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Hoxc10P31257 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxc10P31257 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms