Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd28P31041 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms