Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cdk4P30285 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdk4P30285 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms