Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Casp1P29452 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms