Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CtgfP29268 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CtgfP29268 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms