Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mmp3P28862 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mmp3P28862 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms