Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PtprmP28828 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprmP28828 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprmP28828 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprmP28828 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprmP28828 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprmP28828 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtprmP28828 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprmP28828 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
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