Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

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Length 369 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BgnP28653 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BgnP28653 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BgnP28653 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BgnP28653 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BgnP28653 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BgnP28653 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BgnP28653 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BgnP28653 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BgnP28653 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BgnP28653 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BgnP28653 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
BgnP28653 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BgnP28653 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
BgnP28653 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BgnP28653 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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