Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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Hoxd10P28359 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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Hoxd10P28359 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Hoxd10P28359 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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Hoxd10P28359 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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Hoxd10P28359 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Hoxd10P28359 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Hoxd10P28359 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Hoxd10P28359 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Hoxd10P28359 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Hoxd10P28359 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Hoxd10P28359 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxd10P28359 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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