Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Hoxd9P28357 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxd9P28357 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms