Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Defa5P28312 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms