Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa3P28310 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa3P28310 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Defa3P28310 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms