Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vav1P27870 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vav1P27870 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms