Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd40lgP27548 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms