Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
U2af2P26369 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
U2af2P26369 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U2af2P26369 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms