Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CftrP26361 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CftrP26361 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CftrP26361 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CftrP26361 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CftrP26361 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CftrP26361 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CftrP26361 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CftrP26361 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CftrP26361 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CftrP26361 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CftrP26361 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CftrP26361 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CftrP26361 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CftrP26361 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CftrP26361 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CftrP26361 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CftrP26361 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CftrP26361 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CftrP26361 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CftrP26361 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CftrP26361 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CftrP26361 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CftrP26361 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CftrP26361 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CftrP26361 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CftrP26361 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CftrP26361 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CftrP26361 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CftrP26361 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CftrP26361 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CftrP26361 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CftrP26361 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CftrP26361 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CftrP26361 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CftrP26361 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CftrP26361 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CftrP26361 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CftrP26361 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CftrP26361 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CftrP26361 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CftrP26361 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CftrP26361 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CftrP26361 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CftrP26361 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CftrP26361 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CftrP26361 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CftrP26361 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CftrP26361 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CftrP26361 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CftrP26361 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CftrP26361 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CftrP26361 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CftrP26361 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CftrP26361 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CftrP26361 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CftrP26361 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CftrP26361 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CftrP26361 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CftrP26361 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CftrP26361 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CftrP26361 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CftrP26361 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CftrP26361 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CftrP26361 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CftrP26361 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CftrP26361 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CftrP26361 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CftrP26361 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CftrP26361 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CftrP26361 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CftrP26361 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CftrP26361 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CftrP26361 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms