Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ctnna1P26231 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms