Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 AC160863.4-201ENSMUST00000218099 1334 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm43815-201ENSMUST00000197676 990 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm9742-202ENSMUST00000222219 1396 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm29286-202ENSMUST00000187736 537 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxd11P23813 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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