Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gja1P23242 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gja1P23242 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms