Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Eif3aP23116 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Eif3aP23116 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms