Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RarbP22605 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RarbP22605 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RarbP22605 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RarbP22605 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RarbP22605 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RarbP22605 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RarbP22605 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RarbP22605 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RarbP22605 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RarbP22605 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RarbP22605 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RarbP22605 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RarbP22605 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RarbP22605 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RarbP22605 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RarbP22605 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RarbP22605 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RarbP22605 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RarbP22605 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RarbP22605 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RarbP22605 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RarbP22605 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RarbP22605 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RarbP22605 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RarbP22605 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RarbP22605 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RarbP22605 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RarbP22605 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RarbP22605 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RarbP22605 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RarbP22605 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RarbP22605 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RarbP22605 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms