Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clk1P22518 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms