Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tap1P21958 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms