Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Abcb1aP21447 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms