Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TP20293 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TP20293 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TP20293 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TP20293 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TP20293 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms