Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pou5f1P20263 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou5f1P20263 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms