Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PdgfaP20033 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms