Protein–RNA interactions for Protein: P19221

F2, Prothrombin, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P19221 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F2P19221 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
F2P19221 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
F2P19221 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F2P19221 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F2P19221 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F2P19221 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F2P19221 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F2P19221 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F2P19221 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
F2P19221 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms