Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RargP18911 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RargP18911 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RargP18911 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RargP18911 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RargP18911 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RargP18911 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RargP18911 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RargP18911 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RargP18911 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RargP18911 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RargP18911 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RargP18911 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RargP18911 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RargP18911 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RargP18911 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RargP18911 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RargP18911 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RargP18911 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RargP18911 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RargP18911 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RargP18911 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RargP18911 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RargP18911 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RargP18911 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RargP18911 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RargP18911 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RargP18911 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RargP18911 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RargP18911 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RargP18911 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RargP18911 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms