Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rps6ka1P18653 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rps6ka1P18653 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms