Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18530 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
P18530 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
P18530 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
P18530 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
P18530 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
P18530 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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